Das FFH-Gebiet "Mittleres Altmühltal mit Wellheimer Trockental und Schambachtal" ist ein Kernbereich der national bedeutsamen Verbundachse Altmühltal und wichtigster Biotopverbund für Trocken- und Felsstandorte in der südlichen Fran-kenalb mit wertvollen Waldlebensraumtypen und einem der wenigen Vorkommen der Mannie in Bayern.

Es überschneidet sich in großen Teilen mit dem Vogelschutzgebiet " Felsen und Hangwälder im Altmühltal und Wellheimer Trockental."

Das FFH- und Vogelschutzgebiet verteilt sich über die Landkreise Eichstätt, Neuburg-Schrobenhausen und Weißenburg-Gunzenhausen. Im Landkreis Neuburg-Schrobenhausen sind der Mauerner und Rohrbacher Hang sowie der Hüttinger Hang Teil des europäischen Biotopverbundes.

Hier vorhandene Lebensraumtypen sind natürliche, eutrophe Seen, naturnahe Kalk-Trockenrasen, feuchte Hochstaudenfluren, magere Flachland-Mähwiesen, Kalkfelsen mit Felsspaltenvegetation und Buchenwälder. Durch die Vielfalt an unterschiedlichen Lebensräumen sind hier verschiedene, gefährdete Arten, wie Orchideen, Bachmuschel, Gelbbauchunke, Groppe, Dunkler Wiesenknopf-Ameisenbläuling, Uhu, Wanderfalke, Wespenbussard, Grauspecht, Neuntöter, Schwarzspecht oder Dorngrasmücke beheimatet.